Eclipse web项目引用其它项目时的部署问题

为了项目调试方便，并没有采用jar包方式引用，而是直接引用的项目；项目中用到了引用项目中的Servlet，项目启动也成功了，没有报任何的异常；但是只要一用到引用项目中的Servlet，就报下面的错误：

java.lang.ClassNotFoundException: com.messagePush.core.LongPollingServlet
    at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1720)
    at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1571)
    at org.apache.catalina.core.DefaultInstanceManager.loadClass(DefaultInstanceManager.java:529)
    at org.apache.catalina.core.DefaultInstanceManager.loadClassMaybePrivileged(DefaultInstanceManager.java:511)
    at org.apache.catalina.core.DefaultInstanceManager.newInstance(DefaultInstanceManager.java:139)
    at org.apache.catalina.core.StandardWrapper.loadServlet(StandardWrapper.java:1148)
    at org.apache.catalina.core.StandardWrapper.allocate(StandardWrapper.java:864)
    at org.apache.catalina.core.StandardWrapperValve.invoke(StandardWrapperValve.java:134)
    at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invoke(StandardContextValve.java:122)
    at org.apache.catalina.authenticator.AuthenticatorBase.invoke(AuthenticatorBase.java:501)
    at org.apache.catalina.core.StandardHostValve.invoke(StandardHostValve.java:171)
    at org.apache.catalina.valves.ErrorReportValve.invoke(ErrorReportValve.java:102)
    at org.apache.catalina.valves.AccessLogValve.invoke(AccessLogValve.java:950)
    at org.apache.catalina.core.StandardEngineValve.invoke(StandardEngineValve.java:116)
    at org.apache.catalina.connector.CoyoteAdapter.service(CoyoteAdapter.java:408)
    at org.apache.coyote.http11.AbstractHttp11Processor.process(AbstractHttp11Processor.java:1040)
    at org.apache.coyote.AbstractProtocol$AbstractConnectionHandler.process(AbstractProtocol.java:607)
    at org.apache.tomcat.util.net.JIoEndpoint$SocketProcessor.run(JIoEndpoint.java:314)
    at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(Unknown Source)
    at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(Unknown Source)
    at org.apache.tomcat.util.threads.TaskThread$WrappingRunnable.run(TaskThread.java:61)
    at java.lang.Thread.run(Unknown Source)

后来发现是因为发布的时候引用的项目没有被打包发布到“C:\tomcat7push\webapps\项目名称\WEB-INF\lib”目录的原因。
解决办法：
在项目名称上单击鼠标右键》Properties》Deployment Assembly

请注意，如果你引用的项目是Java Web项目，后面显示了扩展名就是“.war”，这是转换之前的：

如果希望它是“.jar”需要把引用的项目转换为Java项目，有关如何转换的方法请参考“如何将Java Web项目转换为Java项目？”。

保存之后，再重新Build发布项目，引用的项目已经打包到对应的目录下了，如下图：

满心欢喜的启动调试，结果发现问题依旧！！！
究竟是什么原因呢，难道是包有问题？
打开看一下，果然如此：

会发现包里多出了两层目录！！
尝试手动把“com”复制到包的根目录下，问题就解决了。

但这也不是办法啊，到底是什么原因导致了多出两层目录“\WEB-INF\classes”这个问题呢？