搭建高性能计算环境（一）、Linux操作系统的安装和配置

一般课题组刚开始做计算，往往没有专门的集群，主要用自己的PC机、工作站或者买几台服务器来跑跑；小伙伴们摸索Linux的使用、编译一些开源软件、甚至写点Shell脚本需要耗费很多时间，耽搁了读文献、码论文的进展。

在此写几篇Blog，将Linux系统的安装、设置，常用软件的安装、编译整理出来，分享给大家(内容只包含单节点的情况，不涉及集群、作业调度系统及跨节点计算)。

1， 安装CentOS6.2。

1）从光盘启动后的界面，开始安装系统。

2）提示检查光盘的完整性，可以跳过。

3）根据提示按下一步。

4）选择语言，默认英文可以按需要选择中文。

4）选择键盘模式、默认US不用改。

5）开始硬盘分区部分。

6）新硬盘会提示此警告，选择Yes。

7）设置机器的主机名，也可以装好后再设置。

8）选择时区，一般选亚洲/上海。

9）设置root用户(管理员)密码，密码过于简单会提示、可以无视。

10）选择custom自定义分区，也可以选择其他项让系统自动分区。

11）此处分3个分区，200M的/boot，4G的交换分区和剩余的全部分到根分区/。

12）选择”write changes to disk”开始按照设置分区并格式化。

13）引导的安装位置，一般不用改(如果用U盘装系统，此处一般需要改动)。

14）选择要安装的软件包，可以根据需要在custom中选择全部的软件包，此处选择开发工作站。

15）开始安装选择的软件包，根据机器配置和选择的软件包数量需要的时间不定。

16）系统安装完成，重新启动。

17）系统重启中。

18）系统首次启动需要配置一些选项。

19）选择Yes。

20）创建一个普通用户，输入用户名、密码。

21）设置好系统时间。

22）kdump为系统如果异常崩溃，会将内存转储到core文件中，以便以后分析原因，一般人也看不懂这个信息，所以关掉吧(如果机器内存太小，这个就根本不能选Enable)。

23）选择Finish正式进入系统。

2， 系统设置(使用root用户登录系统)。

1） 关闭防火墙。

打开一个终端，输入setup，回车，出现如下画面。

选择Firewall configuration回车，去掉Enable的选择

选择OK回车，提示警告确认，选择YES。

2） 关闭一些不需要的服务。

在终端输入

chkconfig iptables off

chkconfig ip6tables off

chkconfig abrt-ccpp off

chkconfig abrt-oops off

chkconfig abrtd off

chkconfig NetworkManager off

chkconfig avahi-daemon off

chkconfig bluetooth off

chkconfig certmonger off

chkconfig iscsi off

chkconfig iscsid off

chkconfig kdump off

chkconfig libvirtd off

chkconfig libvirt-guests off

chkconfig postfix off

chkconfig qpidd off

3） 关闭selinux。

编辑selinux文件，修改为SELINUX=disabled(重启后生效)

gedit /etc/sysconfig/selinux

4） 设置网络。

进入setup打开画面的Network configuration选项

选择Device configuration为网卡配置IP地址

网卡一般显示为eth0、eth1等，一般服务器都有两个以上的网卡，本机只有一块网卡eth0

为eth0网卡设置地址，如果是自动获取ip选择use dhcp然后直接选择ok

使用DNS configuration配置主机名和DNS

填入相应的主机名和dns信息

网络配置好后一定要使用Save&Quit保存网络设置信息并退出界面

注意：因为系统默认开启NetworkManager管理网络，所以推荐手动修改网卡配置文件/etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-ethX中的ONBOOT的no为yes，使网络能随机器开机启动。

若机器有多个网卡，可以使用ethtool –p eth0来定位eth0对应的网口(网口有灯闪烁)。

5） 修改/etc/hosts文件，加入自己的主机名。

如果是固定ip建议写成如下两行：

127.0.0.1 localhost

自己的ip 自己的主机名

操作系统的安装配置到此结束。